孔雀鱼可以看尾鳍、背鳍、腹鳍、腹部和体色来分公母，公鱼的尾鳍和背鳍很长，腹鳍较窄，腹部被白肚皮包着，体色艳丽，而母鱼的尾鳍、背鳍和腹鳍较短较宽，呈扇形，腹部可见内部颜色，体色单一。或者是从胎斑，它是母孔雀鱼独有的特征，位于母孔雀鱼腹部靠近肛门的位置，那里有一块颜色较深的地方，就是母孔雀鱼的胎斑。不同品种的母孔雀鱼胎斑颜色不同，一般呈浅红色或黑色。母鱼越是临近生产期，它的胎斑颜色就会越发明显，根据这一点也可以很容易看出孔雀鱼的雌雄。