酋长短鲷的繁殖有点麻烦，它们的产卵量通常在40～60粒左右，但受精卵孵化率很低，一直是困扰成功繁殖的问题关健。酋长短鲷产卵了，繁殖用水(1)活性碳过滤水：将活性碳装入塑料或搪瓷圆桶中，让自来水从底部的进水口流入，从顶部的出水口流出。过滤后的水贮存在水族箱或其他容器中，既可作日常饲养用水，又可作普通热带鱼的繁殖用水。(2)离子交换树脂过滤水：将离子交换树脂作过滤材料，借助于阴阳离子交换树脂的吸附能力，可将水中的钙离子、镁离子、亚硝酸盐吸附。(3)去离子水：又名蒸馏水。一般采用电渗析和电解法来获得，水质非常纯净。去离子水的水质极软，水中含氧量极低，不适宜作饲养用水。使用时，常采用与清洁水兑掺的方法，来获得不同硬度和酸碱度的水质，满足不同品种繁殖用水的需要。(4)雨水：水质较软，金属离子含量很少，一般可选市郊地区空气清新的地方，用容器盛装雨落水，再经过滤后即可使用。